Источник: Письмо Минфина от 07.09.2018 № 03-07-11/63996

По правилам при приобретении услуг по перевозке работников к месту командировки и обратно в книге покупок регистрируются либо соответствующие счета-фактуры, либо БСО, выданные работнику и включенные им в отчет о служебной командировке.

Так вот в случае, когда речь идет об электронном билете на самолет, бланком строгой отчетности, на основании которого можно принять НДС к вычету, будет маршрут/квитанция электронного пассажирского билета. Если же работник отправился в командировку на поезде, то работодатель может принять НДС к вычету на основании контрольного купона электронного проездного документа (билета).

Обратите внимание, что в этих документах сумма НДС обязательно должна быть выделена отдельной строкой. Кроме этого, и маршрут/квитанцию, и контрольный купон нужно распечатать на бумаге.