Как разъяснила ФНС, как в бумажном, так и в электронном счете-фактуры нет необходимости проставлять прочерки, чтобы показать, что те или иные показатели (например, реквизиты прослеживаемости) отсутствуют.

Ну и вообще, что касается счетов-фактур на непрослеживамые товары, то в электронном документе графы для реквизитов прослеживаемости просто не формируются, а в бумажном их можно (но не обязательно) сохранить. При этом допускается как оставить их пустыми, так и заполнить прочерками.

Источник: Письмо ФНС от 01.02.2022 № ЕА-4-26/1125@