По мнению ФНС в таком случае, транспортный налог уплачивается по месту нахождения автомобиля, определенному по состоянию на первое число месяца, в котором машина была перерегистрирована на новое ОП.

Соответственно, за месяц, в котором произошло это изменение, налог уплачивается по старому месту нахождения транспортного средства и по старой ставке. А по месту нахождения нового обособленного подразделения налог уплачивается начиная со следующего месяца.

Источник: Письмо ФНС от 31.08.2022 № БС-4-21/11473@