Да, действует.
Соответственно, при расчетах через сервис быстрых платежей между организациями и/или индивидуальными предпринимателями ККТ можно не применять.
Исключение то же, что при прочих безналичных расчетах: применение ККТ обязательно, если расчет производится с использованием электронного средства платежа с его предъявлением.
Источник: Письмо ФНС от 15.06.2022 № ЗГ-3-20/6261@