Как известно, НДФЛ не облагаются те компенсационные выплаты, в том числе связанные с исполнением сотрудником трудовых обязанностей, которые установлены законом.

Гарантии вахтовикам установлены статьей 302 ТК. При этом эта статья не предусматривает обязанность работодателя компенсировать сотрудникам, работающим вахтовым методом, стоимость проезда от дома до места сбора. Соответственно, нет и оснований не начислять с суммы такой оплаты НДФЛ.

А вот с оплатой проезда от места сбора до вахты ситуация иная. В случае, когда из-за труднодоступности места вахты или в связи с производственной необходимостью доставка работников до вахты происходит организованно из пункта сбора, работник, прибывший на пункт сбора, уже, по сути, приступает к исполнению своих трудовых обязанностей и должен подчиняться правилам внутреннего трудового распорядка. Соответственно, оплата работодателем стоимости проезда работника от места нахождения организации или пункта сбора до места вахты не образует у вахтовика облагаемый НДФЛ доход.

Источник: Письмо Минфина от 29.12.2021 № 03-03-06/3/107474

О нюансах организации вахтового метода работы можно прочитать в Путеводителе по кадровым вопросам.